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临床医学系于2008年在原学院医卫系基础上组建而成，至今已有60余年专业办学历史。是全国“3+2”卓越医生培训项目单位、贵州省乡村医生培养单位和全科医生岗位培训项目单位和黔东南州“232”医学人才培养项目单位。
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黔东南职院护理系前身为黔东南州卫生学校护理专业，沿袭至今已有60余年的护理职业教育历史。2003年被教育部等六部委确定为国家“护理专业技能型紧缺人才培养培训工程”基地；2007年成为中央财政支持建设的护理专业重点实训基地之一；2013年被贵州省民政厅授予“贵州省养老护理员培训基地”；2016年护理（老年护理）专业被教育部、民政部、国家卫计委确定为首批全国职业院校养老服务示范专业点；2017年获贵州省人才培养质量提升工程老年护理省级优秀教学团队；2018年护理系第一党支部获批首批全国“党建工作样板支部”培育创建单位，并于2020年通过评审验收为全国首批“党建工作样板支部”。2019年先后获批为教育部“1+X”老年照护、母婴护理职业技能等级证书试点及老年照护社会人员培训基地。2021年，护理系第一党支部获批全省党支部标准化规范化建设示范点、护理系获批贵州省“三全育人”综合改革试点标杆院系。2022年获批首批全国急救教育试点学校。
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医药技术系成立于2008年7月。现设置有药学、医学检验技术、药品生产技术、食品加工技术等高职专业，其中药学专业为国家级骨干专业，药学专业教学团队为省级优秀教学团队。现有教职员工50人，其中，专任教师48人，专任教师中副教授14人，讲师27人，博士1人，研究生14人，在读研究生5人，执业药师5人，主管药师1人，药师5人，执业医师1人，副主任技师1人，主管技师2人，临床医学检验技术师7人。外聘教学团队52人，其中，药学专业25人，医学检验技术专业20人，食品加工技术专业7人，高级职称26人，中级及以下26人。双师比例达到65%。 截至2020年9月，医药技术系现有学生1252人，其中在校生689人,顶岗实习学生245人，毕业生318人。
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生物与环境工程系是在贵州省黔东南民族农业学校、黔东南苗族侗族自治州卫生学校（国家级重点中专）、黔东南苗族侗族自治州财贸学校、黔东南苗族侗族自治州民族林业学校于2001年8月经贵州省人民政府批准、教育部备案合并组建黔东南民族职业技术学院后，于2008年9月整合原贵州省黔东南民族农业学�：颓厦缱宥弊遄灾沃菝褡辶忠笛Ａ叫５淖试矗闪⑸镉牖肪彻こ滔怠�
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财经系办学经验丰富，历史悠久，财经系前身是1959年成立的黔东南州财经职工培训学校，先后经历了黔东南州财经职工培训学校、黔东南州财经干部学校、黔东南州财贸学校等办学时期、有着半个多世纪的办学历史。财经系多年磨砺，打造出一支省级优秀教学团队，现有教职工38人，其中教授1人、副教授10人、高级网络工程1人、讲师18人，有注册会计师资格2人、会计师9人、资产评估师2人、经济师2人；现有1217名学生，共25个教学班。开设有会计、审计、财务管理3个专业，其中会计专业为省级骨干专业，拥有5个教研室及8个实训室。学生参加初级会计资格考试通过率达到20% ，就业率达到98%以上。
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港中旅旅游学院是黔东南民族职业技术学院与中国旅游集团（原港中旅集团）在2004年创建的旅游与商务管理系的基础上于2015年建立的二级学院。港中旅旅游学院成立，旨在通过校企合作共同推进具有国际水准和苗侗民族文化素养的特色旅游人才的培养。2022年与万达酒店集团深度合作，成了黔东南民族职业技术学院万达酒店及度假村产业学院。目前开设有旅游管理、旅游管理（酒店管理与数字化运营方向）、电子商务、烹饪工艺与营养四个专业，在校生规模为1200余人。现有专任教师34人，其中教授3人、副教授10人，博士3人、硕士9人、“双师”占比达90%。
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口腔医学系简介 我院口腔类专业创办于1981年，有40多年办学历史，是贵州省最早开办口腔类专业的高职高专院校。经过多年发展，现有一支综合素质优良、业务过硬、爱岗敬业、教风严谨专兼结合的教学团队。共有专兼职教师45人，其中口腔专业教师35人。系内有教职工28人，其中教授1人，副教授8人，讲师（含实验师）12人；副主任医师2人，主治医师17人，医学专业“双师素质”教师100%。校内口腔类设备总价值912.84万元，生均实验实训仪器设备值9588元，建有口腔解剖实训室、仿头模实训室、口腔临床模拟实训室、技工蜡型实训室、牙片室、消毒室等19个校内实训室；共有40多个设施完善技术雄厚的校外实训基地。丰富的教学经验、优越的实习条件及先进的管理理念，实现学生优质就业。系内专业有口腔医学、口腔医学技术两个专业，其中口腔医学专业2012年成为“中央财政支持高等职业学校提升专业服务能力建设项目”重点建设专业，2016年成为贵州省省级骨干专业，2020年获兴黔富民省级特色骨干专业，2022年与贵州医科大学在校内建立口腔医学专升本联合办学点。
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物联网技术系成立于2013年，现开设物联网应用技术、电子信息工程技术2个高职专业，物联网应用技术专业群为院级重点建设专业群。现有校内专业实训室20个和综合性生产实训基地3个，省内外实习实训基地41个。
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培养目标：本专业培养德智体美劳全面发展，掌握扎实的科学文化基础和建筑制图、建筑材料、建筑力学、建筑构造、建筑结构、工程测量、工程岩土等知识，具备解决一般建筑工程施工技术问题，以及建筑施工合同管理、进度管理、质量管理、安全管理、技术资料管理和成本控制等能力，具有工匠精神和信息素养，能够从事建筑施工技术与施工管理等工作的高素质技术技能人才。
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2013年黔东南民族职业技术学院与省中小企业局、州工信委联合在学院旅游与商务管理系开办了旅游工艺品设计与制作专业；经过历年来的有效办学实践，2015年开始筹建民族文化创意产业教学机构；2017年5月省州编制管理部门正式批复设立民族文化创意产业系；2018年6月系领导班子就位正式成立；为深入贯彻国家关于深化产教融合、校企合作、育训结合，健全多元化办学格局，推动企业深度参与职业教育协同育人的战略部署，经深入友好磋商，于2019年6月，与40余家单位，集合校政企行研多方资源，在民族文化创意产业系办学基础上共建国内第一家民艺学院（二级学院），实行理事会管理模式，两块牌子一套人马。主动承载起培养苗侗民族文化产业高素质技术技能应用型人才重任，着眼培养具有传统文化素养、现代设计理念和国际视野的高素质传承创新人才。办学过程中，学院始终坚持传承弘扬中华优秀传统文化，聚焦地方民族文化产业，培育新时代工匠，秉承根植民族地区、弘扬民族文化、培育民族工匠、服务民族产业的办学定位，努力推动中华优秀传统文化创造性转化和创新性发展。
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